Built for Green Life: DeepGreenGO Reads Plant Proteins Where Other

DeepGreenGO es un nuevo modelo de aprendizaje profundo diseñado para entender mejor qué hacen los genes de las plantas, un área históricamente poco anotada en comparación con proteínas de humanos, ratones y levaduras. El proyecto, desarrollado por investigadores de la University of Colombo y la Sri Lanka Institute of Information Technology, se describe en BMC Bioinformatics y entrena únicamente con proteínas vegetales, evitando modelos “mixtos” donde las plantas son solo una fracción del conjunto. Para demostrarlo, el equipo usó el sistema para identificar genes relacionados con el desarrollo de semillas en arroz. La arquitectura combina una vista lingüística basada en ProtBERT-BFD con información estructural mediante mapas de contacto y redes neuronales grafo (incluyendo capas GATv2).